實時熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)是一種以PCR反應為基礎的DNA定量技術,通過對目標基因在擴增過程中產(chǎn)生的拷貝數(shù)進行實時的定量,從而達到對目的基因的定性和定量分析?,F(xiàn)有兩種常用的方法對PCR產(chǎn)物進行熒光定量:一種是利用熒光染料與雙鏈DNA結合,通過熒光強度進行熒光定量;另一種是利用攜帶了熒光報告基因的特異性DNA探針對目標基因進行定量。
常用熒光染料有:SYBR GreenⅠ、EvaGreen、LC Green等
Taqman熒光探針作為定量檢測的首選,是一種寡核苷酸,充當DNA復制的起點,熒光基團連接在探針的5'末端,淬滅劑連接在3'末端。PCR擴增時加入引物和探針,探針完整時,報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,探針酶切降解,報告熒光基團與淬滅熒光基團分離,熒光信號被系統(tǒng)檢測接收,每擴增一條DNA鏈伴隨一個熒光分子形成,實時熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物同步進行,實現(xiàn)實時定量的實驗結果。相對于SYBR熒光染料具有序列特異性,直結合到互補區(qū)的強靈敏度。相較于雜交探針,其只需設計一條探針,既方便也能完成定量PCR要求。
獲得游離5,-羥基→合成DNA原料→帶帽(capping)反應→轉化為穩(wěn)定磷酸三酯→重復步驟4
探針引物設計實驗流程:
目的基因查找比對→探針與引物設計→合成
熒光定量QPCR實驗流程:
取材→RNA提取逆轉錄成cDNA→實時熒光定量PCR-(QPCR產(chǎn)物電泳)→數(shù)據(jù)分析
基因名稱和種屬、或已知探針引物序列、或基因ID號
熒光定量QPCR送樣運輸要求:
組織、細胞:-80℃保存,干冰運輸;
血液:EDTA抗凝管,4℃運輸;
RNA樣本:體積≥10 μL,干冰運輸。