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背景簡(jiǎn)介

RNA immunoprecipitation sequencing (RIP-seq)是RNA免疫共沉淀結(jié)合高通量測(cè)序的一種技術(shù)，通過(guò)免疫沉淀靶蛋白來(lái)捕獲互作的RNA。其原理是運(yùn)用針對(duì)目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來(lái)，然后經(jīng)過(guò)分離純化獲得結(jié)合在復(fù)合物上的RNA，再通過(guò)高通量測(cè)序?qū)崿F(xiàn)對(duì)目的RNA的信息分析。RIP技術(shù)與高通量測(cè)序的結(jié)合，能幫助研究人員從全基因組層面了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)態(tài)過(guò)程。

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

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分析流程

分析內(nèi)容

樣本類(lèi)型

個(gè)體較小動(dòng)物如小鼠、雛雞、斑馬魚(yú)等肝臟、心臟、腦等組織>1g；
個(gè)體較大動(dòng)物如豬、牛、羊等肌肉、晚期胚胎等組織>2g，脂肪組織>10g；
昆蟲(chóng)等整只個(gè)體>3g；
腫瘤組織>1g；
植物組織：果實(shí)>10g，花序、花蕊、花粉>2g，其他部位>5g；
細(xì)胞樣本>1×108個(gè)