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外泌體RNA測序

目    錄
  • 產(chǎn)品介紹
  • 常見問題
  • 經(jīng)典案例
  • 結(jié)果展示

背景簡介

外泌體(Exosome)是由包括腫瘤細胞在內(nèi)的幾乎所有類型的細胞都可以產(chǎn)生并釋放的一種微囊,其內(nèi)部包裹了DNA,RNA,蛋白等物質(zhì)。眾多的研究表明,外泌體在血液,乳汁,尿液等體液內(nèi)傳播,其內(nèi)容物如miRNA可被其他細胞吞噬,成為細胞間通訊的重要介質(zhì)。越來越多的證據(jù)表明,宿主細胞或腫瘤細胞分泌的外泌體參與了腫瘤發(fā)生、生長、侵襲和轉(zhuǎn)移。        外泌體上述特征和生物學功能,使其成為液體活檢領(lǐng)域的重要研究對象,其所含RNA分子如miRNA,lncRNA,circRNA等是極具應用前景的臨床診斷分子標志物。聯(lián)川生物依托豐富的RNA項目經(jīng)驗和領(lǐng)先的生信分析實力,推出了針對外泌體RNA研究的系統(tǒng)解決方案,將協(xié)助科研人員深度開展外泌體mRNA、miRNA、lncRNA等的鑒定和功能分析.

技術(shù)優(yōu)勢

國內(nèi)最早的外泌體研究科技服務商,外泌體RNA項目經(jīng)驗豐富
芯片和測序兩大高通量檢測平臺,滿足外泌體RNA的不同分析需求
采用更低樣本量和專業(yè)外泌體分離試劑盒,更能勝任外泌體實驗的獨特性
多套外泌體RNA研究方案,滿足外泌體mRNA,lncRNA,miRNA的不同研究需求

技術(shù)路線

分析內(nèi)容

  

樣本類型

血清(≥2 mL),血漿(≥ 2 mL),細胞上清液(≥ 15 mL),
乳汁(≥10 mL),尿液(≥ 15 mL),無DNA污染的總RNA等
建議總RNA起始量(單次):≥1 μg,濃度≥ 20 ng/μL (原則上越多越好)


近期用戶文章 
1. Gu Y, Li M, Wang T, et al. Lactation-Related MicroRNA Expression Profiles of Porcine Breast Milk Exosomes[J]. Plos One, 2012, 7(8):e43691.
2. Gildea J J, Carlson J M, Schoeffel C D, et al. Urinary exosome miRNome analysis and its applications to salt sensitivity of blood pressure.[J]. Clinical Biochemistry, 2013, 46(12):1131-1134.
3. Yelamanchili S V, Lamberty B G, Rennard D A, et al. MiR-21 in Extracellular Vesicles Leads to Neurotoxicity via TLR7 Signaling in SIV Neurological Disease[J]. Plos Pathogens, 2015, 11(7):e1005032.
4. Song M, Wang Y, Shang Z F, et al. Bystander autophagy mediated by radiation-induced exosomal miR-7-5p in non-targeted human bronchial epithelial cells:[J]. Sci Rep, 2016, 6:3016

Q1:外泌體的提取方法有哪些?
A:外泌體的提取/富集方法有超高速離心,密度梯度離心,流式、磁珠篩選,高分子聚合物等。需要根據(jù)樣品類型的不同選擇不同的提取方法,這四類提取方法的外泌體產(chǎn)量、純度以及所需樣品量均不同,需要根據(jù)實際情況選擇對應的提取方法。

Q2:如何進行外泌體鑒定?
A:外泌體鑒定目前采用的是電鏡和West-blot。典型的外泌體電鏡觀察圖是30-100nm 大小的球形或碗形囊泡。West-blot鑒定時可以選擇外泌體特異性蛋白做 West-blot 鑒定。 WB 可以選擇最多的蛋白一般是和 MVBs 合成相關(guān)的蛋白(Alix、 TSG101)及四次跨膜蛋白(CD9, CD63,CD81, CD82),同時 WB 時能做 non exosome marker 最好,比如,GRP94, EEA1,Cytochrome c, GM130, PMP70, Calreticulin, prohibitin 等,這些蛋白都是 exosome 沒
有,細胞總蛋白中才有。

非靶向人類支氣管上皮細胞旁自噬由輻射誘導的外泌體miR-7-5p介導


研究背景
輻射誘導的旁效應(RIBE)描述了一組非靶向細胞接收輻照細胞旁信號的生物學效應。在放射治療中,RIBE會給癌旁正常組織帶來潛在危害,具有比預想更高的風險。從輻照細胞到細胞外微環(huán)境,某些物質(zhì)的過量釋放會造成有害的影響。例如,細胞因子和活性氧已被證實通過細胞外介質(zhì)或縫隙連接參與RIBE過程。然而,RIBE介導的信號和細胞間信息通路尚不完全清楚。


研究結(jié)果
在這項研究中,運用miRNA微流體芯片對外泌體miRNA進行了差異表達譜分析。研究人員首次從受2Gy γ射線照射的人支氣管上皮BEP2D細胞的外泌體中鑒定出一組差異表達的miRNA。其中,外泌體中的miR-7-5p被發(fā)現(xiàn)誘導受體細胞自噬。外泌體介導的自噬明顯被miR-7-5p抑制劑減弱。此外,我們的數(shù)據(jù)表明,由外泌體miR-7-5p誘導的自噬與EGFR PI3K/AKT/mTOR信號通路相關(guān)。同時,研究結(jié)果支持外泌體參與RIBE信號傳播到旁細胞的過程。其中外泌體miR-7-5p是旁自噬的重要介質(zhì)。


 
圖 受體BEP2D細胞通過外泌體miR-7-5p誘導旁自噬
參考文獻
Song M, Wang Y, Shang ZF, Liu XD, Xie DF, Wang Q, Guan H, Zhou PK. (2016) Bystander autophagy mediated by radiation-induced exosomal miR-7-5p in non-targeted human bronchial epithelial cells. Scientific Reports. 6:30165.

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