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RIP-seq

目    錄
  • 產(chǎn)品介紹
  • 常見問題
  • 經(jīng)典案例
  • 結(jié)果展示

背景簡(jiǎn)介

RNA immunoprecipitation sequencing (RIP-seq)是RNA免疫共沉淀結(jié)合高通量測(cè)序的一種技術(shù),通過(guò)免疫沉淀靶蛋白來(lái)捕獲互作的RNA。其原理是運(yùn)用針對(duì)目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來(lái),然后經(jīng)過(guò)分離純化獲得結(jié)合在復(fù)合物上的RNA,再通過(guò)高通量測(cè)序?qū)崿F(xiàn)對(duì)目的RNA的信息分析。RIP技術(shù)與高通量測(cè)序的結(jié)合,能幫助研究人員從全基因組層面了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)態(tài)過(guò)程。

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

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分析流程

分析內(nèi)容

樣本類型

個(gè)體較小動(dòng)物如小鼠、雛雞、斑馬魚等肝臟、心臟、腦等組織>1g;
個(gè)體較大動(dòng)物如豬、牛、羊等肌肉、晚期胚胎等組織>2g,脂肪組織>10g;
昆蟲等整只個(gè)體>3g;
腫瘤組織>1g;
植物組織:果實(shí)>10g,花序、花蕊、花粉>2g,其他部位>5g;
細(xì)胞樣本>1×108個(gè) 

Peak 在基因功能元件上的分布

peak 以及周邊基因結(jié)構(gòu)的可視化

motif 分析

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